Fonksiyonel tedavi büyüme gelişimi aktif olan çocuklarda yapılan çenelerin iskeletsel bozukluklarını çözmek için yapılan tedavidir. Özellikle üst çenesi önde veya geride yada alt çenesi geride olan çocuklarda headgear apareyi,

yüz maskesi ve bianatör gibi fonksiyonel apareylerle bu problemler çözülebilir.